В золотом щите московской формы знак атома – черный шар в окружении двух перекрещенных вытянутых черных колец. В голубой главе серебряная щука.
Знак атома символизирует находящийся на территории муниципального образования Курчатовский институт и комплекс других крупных научно-исследовательских институтов.
Щука в голубой главе щита символизирует древнее (XV-XVII вв.) село, а затем деревню Щукино.
Деревня находилась на берегу Москвы-реки, в 1701 г. при ней числился пруд, богатый рыбой, и мельница на реке Химке.
Древнее название деревни воплотилось в современном названии территории, а изображении щуки вошло в герб как гласный символ муниципального образования.